L'un des résultat des réactions d'hydrotraitement est la production de sulfure d'hydrogène et d'ammoniac qui provient des contaminants éliminés des flux d'hydrocarbures. Lorsque les effluents du réacteur d'hydrotraitement sont refroidis par les échangeurs de chaleur ultérieurs, le sulfure d'hydrogène, l'ammoniac et les chlorures en phase gazeuse (lorsqu'ils sont présents) se combinent pour former du bisulfure d'ammonium et du chlorure d'ammonium. L'endroit précis où cela se produit dans le système échangeur dépend de la concentration et de la température. Si des dépôts se produisent, une corrosion sous dépôts peut avoir lieu.

Afin de minimiser cette corrosion, les raffineurs utilisent généralement des stratégies de lavage à l'eau et de surveillance du système. Avec un degré élevé de contaminants, les inhibiteurs de corrosion par filmage peuvent réduire la corrosion sur la surface de traitement, et la chimie des dispersants salins peut minimiser le potentiel de dépôt dans le système. Cette combinaison peut aider à contrôler la corrosion dans les échangeurs d'effluents du réacteur.